sábado, 1 de julio de 2023

RT-PCR, Coronavirus

Las muestras para la prueba diagnóstica se recolectan mediante hisopos nasales y orofaríngeos. En la fase de extracción del ARN participan una mezcla de cebadores directos e inversos, agua libre de nucleasas, una sonda extintora de fluoróforos y una mezcla de reacción (magnesio, transcriptasa, nucleótidos, polimerasa y aditivos). Los materiales replicados mediante la RT-PCR son: el gen M, los genes RdRp y el gen N de la nucleocápside (E, RdRp y N); su presencia determinará la positividad de la prueba, en la RT-qPCR un valor de Ct ≤ 35 se considera positivo.

An overview of the procedure of RT-PCR with sequences of some probesCoronavirus: a comparative analysis of detection technologies in the wake of emerging variants [Internet]. 2022 [citado 01 julio 2023]. Disponible en: https://link.springer.com/article/10.1007/s15010-022-01819-6

Bibliografía:

  1. Aruleba R, Adekiya T, Ayawei N, Obaido G, Aruleba K, Mienye I, Aruleba I, Ogbuokiri B. COVID-19 Diagnosis: A Review of Rapid Antigen, RT-PCR and Artificial Intelligence Methods. Bioengineering [Internet]. 2022 [citado 01 de julio de 2023]; 9(4): 153. Recuperado a partir de: https://www.mdpi.com/2306-5354/9/4/153
  2. Dutta, Debashis, Sarah Naiyer, Sabanaz Mansuri, Neeraj Soni, Vandana Singh, Khalid Hussain Bhat, Nishant Singh, Gunjan Arora, and M. Shahid Mansuri. 2022. COVID-19 Diagnosis: A Comprehensive Review of the RT-qPCR Method for Detection of SARS-CoV-2. Diagnostics [Internet]. 2022 [citado 01 ded julio de 2023]; 12(6):1503. Recuperado a partir de: https://doi.org/10.3390/diagnostics12061503

Reciclaje

Origami con papel reciclado

sábado, 24 de junio de 2023

Técnica de secuenciación - HTR esencial

Diversos factores genéticos se encuentran involucrados en la aparición de la hipertensión arterial esencial (HTR esencial), para determinarlos se utilizan diferentes métodos de secuenciación entre ellos tenemos a la secuenciación Sanger, la cual consiste en la utilización de ADN polimerasa y de desoxinucleótidos trifosfatos (importantes en la suspensión de la reacción de elongación). Con ello se determinaron polimorfismos en locis de BMPR2, ACVRL1 y SMAD9 y el riesgo que conlleva el presentarlos, al tener una relación directa con la presencia de HTR esencial.

Chen Y, Ye C, Chen J, Lin D, Wang H,  Wang S. SNP site sequencing results of the BMPR2ACVRL1, and SMAD9 genes [Internet]. 2019 [citado 23 de junio 2023]. Disponible en:  https://portlandpress.com/bioscirep/article/39/1/BSR20181217/228/Association-of-the-gene-polymorphisms-of-BMPR2

Bibliografía:

  1. Anthony J. BleyerMaggie WestemeyerJing XieMichelle S. BloomKatya BrossartJason J. Eckelet al. Genetic Etiologies for Chronic Kidney Disease Revealed through Next-Generation Renal Gene Panel. Am J Nephrol [Internet]. 2022; [citado 26 de mayo de 2023]; 53(4): 297–306. Recuperado a partir de: https://journals.sagepub.com/doi/10.1177/1040638720905833
  2. Chen Y, Ye C, Chen J, Lin D, Wang H,  Wang S.  Association of the gene polymorphisms of BMPR2, ACVRL1, SMAD9 and their interactions with the risk of essential hypertension in the Chinese Han population. Bioscience reports [Internet]. 2019 [citado 23 de junio de 2023]; 39(1). Recuperado a partir de: https://portlandpress.com/bioscirep/article/39/1/BSR20181217/228/Association-of-the-gene-polymorphisms-of-BMPR2

Reciclaje

Reducir la compra de botellas plásticas y optar por un tomatodo




sábado, 17 de junio de 2023

Colelitiasis - Alteración de la epigenética

Al obtener muestras de tejido de la vesícula biliar de pacientes con colelitiasis y su posible progresión (cáncer de vesícula) se pudo medir el nivel de metilación correspondiente y comprobar cómo el cambio epigenético fue mayor conforme se desarrollaba la enfermedad. Se identificaron 15112 marcadores con niveles de metilación aumentados o disminuidos; entre los 20 marcadores principales a lo largo de la secuencia tenemos a la proteína dedo de zinc 177, el factor de transcripción T-box 15 y varios genes homeobox.

MedlinePlus. Cálculos biliares. [Internet]. 2021 [citado 16 de Junio de 2023]. Disponible en: https://medlineplus.gov/spanish/ency/article/000273.htm

Bibliografía:

  1. Brägelmann J, Barahona C, Marcelain K; Roessler S, Goeppert B, Gallegos I, Colombo A, Sanhueza V, Morales E, Rivera M.T, Toro G, Ortega A, Müller B, Gabler F, Scherer D, Waldenberger M, Reischl E, Boekstegers F, Gárate‐Calderón V, Umu S, Rounge T, Popandá O, Lorenzo J. Análisis de todo el epigenoma de los cambios de metilación en la secuencia de la enfermedad de cálculos biliares, displasia y cáncer de vesícula biliar. Hepatología [Internet]. 2021 [citado 16 de junio de 2023]; 73(6):p 2293-2310. Recuperado a partir de: https://journals.lww.com/hep/Fulltext/2021/06000/Epigenome_Wide_Analysis_of_Methylation_Changes_in.19.aspx
Reciclaje

Separación de residuos






sábado, 10 de junio de 2023

Virus de la influenza - Alteraciones de la traducción

Los virus con el paso del tiempo tienen la capacidad de desarrollar diferentes mecanismos para infectar de una manera más eficiente y eficaz, en el caso del virus de la influenza uno de estos mecanismos corresponde a la proteína viral no estructural NS1, la cual le permite modificar la respuestas del huésped a la infección, es decir, a su presencia en el organismo. La NS1 participará en diferentes procesos como el empalme, la maduración de mRNAs, su salida hacia el citoplasma y la traducción de mRNAs gracias a sus diferentes interacciones con las proteínas p85b, RIG-I o CPSF4.

Journal of Virology The Influenza A Virus Protein NS1 Displays Structural Polymorphism. [Internet]. [citado 09 de Junio de 2023]. Disponible en: https://journals.asm.org/doi/10.1128/jvi.03692-13

Bibliografía:

  1. Dubois J, Calatrava M, Terrier OUn mécanisme inédit de détournement viro-induit de p53 dans le contexte de l’infection par les virus influenza. Med Sci [Internet]. 2020 [citado 09 de junio de 2023]; 36(2). Recuperado a partir de: https://www.medecinesciences.org/en/articles/medsci/full_html/2020/02/msc190304/msc190304.html

Reciclaje

Reutilización de envase plástico como alcancía.




viernes, 2 de junio de 2023

Infección de vías urinarias - Alteraciones de la transcripción

En la infección de vías urinarias causada por Escherichia coli (Escherichia coli uropatógena), se ha desarrollado mecanismos por parte de las bacterias que les permiten infectar de una manera más eficaz las células epiteliales del tracto urinario, al analizar la actividad transcripcional que se ve afectada encontramos la alteración de los genes: L17C, TNFAIP6, TNF, IL20, CXCL2, CXCL3, IL6 y CXCL8. Destaca el hecho de que la forma filamentosa de la bacteria tiene una actividad menor en la utilización de este mecanismo si la comparamos con su forma coliforme. 
Cistitis Centro de información. ¿Qué es la Escherichia coli [Internet]. [citado 02 de Junio de 2023]. Disponible en: https://cistitisderepeticion.com/que-es-escherichia-coli/

Bibliografía:

  1. Persson K, Petersson U, Johansson C, Demirel E, Kruse ETranscriptional alterations in bladder epithelial cells in response to infection with different morphological states of uropathogenic Escherichia coliScientific Reports [Internet]. 2022 [citado 02 de junio de 2023]; 12(486). Recuperado a partir de: https://www.nature.com/articles/s41598-021-04396-0

Reciclaje

Uso de botella plástica para reducir el consumo de agua en el inodoro.



viernes, 26 de mayo de 2023

Enfermedad renal crónica, alteraciones de la genómica

La enfermedad renal crónica (ERCes el fallo en la función renal, de acuerdo con la tasa de filtración glomerular estimada corresponde a un valor de <60 ml/min/1,73. Con el fin de un mejor diagnóstico y tratamiento se buscó determinar los genes causantes de esta enfermedad, donde se incluyeron diferentes trastornos genéticos como el de Alport, la enfermedad renal poliquística, glomeruloesclerosis focal, entre otros; sobretodo resaltan los resultados positivos obtenidos en 48 genes, de los cuales 6 presentaron una mayor frecuencia en los pacientes.
University of Utah Health. CUIDE SUS RIÑONES [Internet]. 2022 [citado 26 mayo 2022]. Disponible en: https://healthcare.utah.edu/healthfeed/2023/03/cuide-sus-rinones

Bibliografía:

  1. Eguiguren-Jiménez L, Miles J, Ocampo J,  Andrade J. Prevalence and associated risk factors of chronic kidney disease: A case study within SIME clinics in Quito, Ecuador 2019-2021. Frontiers in medicine [Internet]. 2022 [citado 26 de mayo de 2023]. Recuperado a partir de: https://doi.org/10.3389/fmed.2022.908551
  2. Anthony J. BleyerMaggie WestemeyerJing XieMichelle S. BloomKatya BrossartJason J. Eckelet al. Genetic Etiologies for Chronic Kidney Disease Revealed through Next-Generation Renal Gene Panel. Am J Nephrol [Internet]. 2022; [citado 26 de mayo de 2023]; 53(4): 297–306. Recuperado a partir de: https://doi.org/10.1159/000522226

Reciclaje

Reutilización de frascos de vidrio 





sábado, 6 de mayo de 2023

BIENVENIDA

Bienvenidos a mi blog. Este es un espacio donde se podrá encontrar información relevante e interesante referente a la biología celular y molecular. Espero que les sea de utilidad el contenido compartido. Si te gusta lo que ves, no dudes en seguirme para estar al tanto de las publicaciones.

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-Robert Collier-

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